В давно забытые времена, когда Земля столкнулась с метеором, легендарный покемон Арсеус использовал свою силу, чтобы предотвратить опасность. Однако этот подвиг привел к тому, что 16 окружающих его плит разлетелись по всему миру. Без пластин, снабжающих Арсея жизненной энергией, он начал умирать. Человеку по имени Дэймон удалось найти одну из Пластин и вернуть ее умирающему покемону, помогая ему выздороветь. В качестве награды Арсеус создал Драгоценность Жизни и отдал ее жителям Мичина-Тауна, оговорив, что ее необходимо вернуть, но люди отказались, забрав Драгоценность себе. В последовавшей битве Дэймон был убит, а Арсеус погрузился в сон, поклявшись наказать человечество по его возвращении. Сатоши и его товарищи прибывают в Мичина-Таун, где они встречают Шину, потомку Дэймона, которая утверждает, что владеет Драгоценностью Жизни, и намеревается вернуть ее Арсеусу, когда он проснется. Ситуация принимает неожиданный оборот, когда Арсеус, несмотря на самые благие намерения Шины, остается неудовлетворенным. Теперь Сатоши должен предотвратить уничтожение всей человеческой расы, поскольку ярость Арсея вызывает искажения в ткани вселенной, приводя в ярость легендарное трио — Диалгу, Палкию и Гиратину — и нарушая баланс в мире. [Написано MAL Rewrite]